документ спросите какой?
хотя я сомневаюсь что вам что-то покажут и сошлются на что-то.
транспортные и заготовительно-складские начисляются на стоимость каждого материала, если вы исключаете стоимость этого материала из ценника по сметной цене соответственно исключаются и ТЗР, а если в счете-фактуре нет стоимости доставки, то добавляется цена ТЗР.
Размер их может быть по согласованию с заказчиком, некоторые пропускают 13% по технической части ценников на материалы.
Читайте техническую часть к сборникам.